Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL1P40616 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL1P40616 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL1P40616 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL1P40616 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL1P40616 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL1P40616 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL1P40616 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL1P40616 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL1P40616 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL1P40616 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARL1P40616 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL1P40616 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL1P40616 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARL1P40616 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL1P40616 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARL1P40616 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARL1P40616 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL1P40616 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL1P40616 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL1P40616 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARL1P40616 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL1P40616 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARL1P40616 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL1P40616 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL1P40616 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARL1P40616 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL1P40616 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARL1P40616 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL1P40616 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL1P40616 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL1P40616 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL1P40616 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARL1P40616 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARL1P40616 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL1P40616 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL1P40616 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARL1P40616 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL1P40616 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL1P40616 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL1P40616 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL1P40616 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARL1P40616 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARL1P40616 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL1P40616 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL1P40616 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL1P40616 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL1P40616 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARL1P40616 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL1P40616 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL1P40616 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL1P40616 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARL1P40616 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL1P40616 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL1P40616 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARL1P40616 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL1P40616 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARL1P40616 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARL1P40616 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL1P40616 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ARL1P40616 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL1P40616 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL1P40616 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARL1P40616 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL1P40616 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL1P40616 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARL1P40616 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARL1P40616 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARL1P40616 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ARL1P40616 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL1P40616 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL1P40616 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL1P40616 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL1P40616 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARL1P40616 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL1P40616 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL1P40616 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL1P40616 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARL1P40616 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms