Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTGER4P35408 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTGER4P35408 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER4P35408 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGER4P35408 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTGER4P35408 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms