Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTNNB1P35222 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CTNNB1P35222 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNNB1P35222 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNB1P35222 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNB1P35222 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTNNB1P35222 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTNNB1P35222 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms