Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTF4P34130 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTF4P34130 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NTF4P34130 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTF4P34130 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NTF4P34130 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTF4P34130 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTF4P34130 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTF4P34130 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTF4P34130 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTF4P34130 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTF4P34130 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTF4P34130 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF4P34130 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF4P34130 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF4P34130 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF4P34130 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTF4P34130 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTF4P34130 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTF4P34130 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NTF4P34130 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTF4P34130 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTF4P34130 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTF4P34130 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTF4P34130 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTF4P34130 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTF4P34130 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTF4P34130 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTF4P34130 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTF4P34130 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTF4P34130 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTF4P34130 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTF4P34130 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTF4P34130 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NTF4P34130 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NTF4P34130 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTF4P34130 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTF4P34130 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTF4P34130 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTF4P34130 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTF4P34130 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTF4P34130 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTF4P34130 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTF4P34130 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTF4P34130 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTF4P34130 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTF4P34130 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTF4P34130 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTF4P34130 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTF4P34130 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTF4P34130 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTF4P34130 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTF4P34130 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTF4P34130 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTF4P34130 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTF4P34130 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTF4P34130 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTF4P34130 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTF4P34130 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTF4P34130 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTF4P34130 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NTF4P34130 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NTF4P34130 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NTF4P34130 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTF4P34130 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTF4P34130 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTF4P34130 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTF4P34130 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTF4P34130 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NTF4P34130 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTF4P34130 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NTF4P34130 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NTF4P34130 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTF4P34130 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTF4P34130 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NTF4P34130 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms