Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD40LGP29965 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD40LGP29965 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD40LGP29965 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CD40LGP29965 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD40LGP29965 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD40LGP29965 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD40LGP29965 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms