Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EPHA2P29317 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHA2P29317 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHA2P29317 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPHA2P29317 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EPHA2P29317 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EPHA2P29317 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms