Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC40■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
PTPRMP28827 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PTPRMP28827 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PTPRMP28827 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PTPRMP28827 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
PTPRMP28827 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
PTPRMP28827 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.62■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.61■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.57■■■■□ 3.93
PTPRMP28827 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
PTPRMP28827 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
PTPRMP28827 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.38■■■■□ 3.9
PTPRMP28827 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
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