Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GABRB3P28472 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GABRB3P28472 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GABRB3P28472 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
GABRB3P28472 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRB3P28472 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRB3P28472 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms