Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMB4P28070 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMB4P28070 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PSMB4P28070 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PSMB4P28070 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMB4P28070 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PSMB4P28070 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSMB4P28070 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 282.5 ms