Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSMB9P28065 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSMB9P28065 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMB9P28065 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMB9P28065 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMB9P28065 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMB9P28065 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSMB9P28065 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms