Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CALRP27797 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALRP27797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CALRP27797 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CALRP27797 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALRP27797 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALRP27797 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALRP27797 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CALRP27797 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALRP27797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALRP27797 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CALRP27797 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALRP27797 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALRP27797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALRP27797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CALRP27797 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALRP27797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALRP27797 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALRP27797 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALRP27797 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CALRP27797 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALRP27797 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALRP27797 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALRP27797 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALRP27797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CALRP27797 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALRP27797 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALRP27797 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CALRP27797 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALRP27797 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALRP27797 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CALRP27797 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALRP27797 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CALRP27797 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALRP27797 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CALRP27797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CALRP27797 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALRP27797 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CALRP27797 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALRP27797 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALRP27797 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CALRP27797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALRP27797 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALRP27797 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CALRP27797 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CALRP27797 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALRP27797 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALRP27797 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALRP27797 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CALRP27797 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALRP27797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALRP27797 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALRP27797 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CALRP27797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALRP27797 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALRP27797 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALRP27797 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALRP27797 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALRP27797 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALRP27797 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALRP27797 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALRP27797 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALRP27797 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CALRP27797 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALRP27797 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALRP27797 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALRP27797 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALRP27797 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALRP27797 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALRP27797 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALRP27797 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALRP27797 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALRP27797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALRP27797 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALRP27797 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALRP27797 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALRP27797 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALRP27797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALRP27797 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALRP27797 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALRP27797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALRP27797 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALRP27797 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALRP27797 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALRP27797 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALRP27797 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALRP27797 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALRP27797 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALRP27797 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALRP27797 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALRP27797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALRP27797 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms