Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA3P26006 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA3P26006 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA3P26006 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA3P26006 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA3P26006 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms