Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCNE1P24864 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCNE1P24864 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCNE1P24864 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCNE1P24864 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCNE1P24864 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCNE1P24864 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCNE1P24864 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms