Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AMPD1P23109 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AMPD1P23109 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AMPD1P23109 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AMPD1P23109 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AMPD1P23109 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AMPD1P23109 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms