Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCMT1P22061 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCMT1P22061 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCMT1P22061 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PCMT1P22061 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCMT1P22061 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCMT1P22061 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCMT1P22061 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms