Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMNB1P20700 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMNB1P20700 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMNB1P20700 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
LMNB1P20700 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
LMNB1P20700 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMNB1P20700 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMNB1P20700 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMNB1P20700 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMNB1P20700 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
LMNB1P20700 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
LMNB1P20700 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
LMNB1P20700 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
LMNB1P20700 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMNB1P20700 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms