Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PVALBP20472 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PVALBP20472 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PVALBP20472 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PVALBP20472 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PVALBP20472 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PVALBP20472 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PVALBP20472 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PVALBP20472 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PVALBP20472 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PVALBP20472 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PVALBP20472 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PVALBP20472 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PVALBP20472 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PVALBP20472 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PVALBP20472 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PVALBP20472 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PVALBP20472 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PVALBP20472 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PVALBP20472 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PVALBP20472 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PVALBP20472 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PVALBP20472 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PVALBP20472 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PVALBP20472 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PVALBP20472 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PVALBP20472 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PVALBP20472 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PVALBP20472 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PVALBP20472 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PVALBP20472 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PVALBP20472 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PVALBP20472 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PVALBP20472 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PVALBP20472 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PVALBP20472 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PVALBP20472 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PVALBP20472 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PVALBP20472 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PVALBP20472 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PVALBP20472 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PVALBP20472 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PVALBP20472 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PVALBP20472 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PVALBP20472 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PVALBP20472 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PVALBP20472 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PVALBP20472 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PVALBP20472 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PVALBP20472 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PVALBP20472 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PVALBP20472 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PVALBP20472 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PVALBP20472 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PVALBP20472 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PVALBP20472 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PVALBP20472 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PVALBP20472 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PVALBP20472 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PVALBP20472 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PVALBP20472 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PVALBP20472 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PVALBP20472 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PVALBP20472 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PVALBP20472 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PVALBP20472 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PVALBP20472 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PVALBP20472 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PVALBP20472 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PVALBP20472 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PVALBP20472 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PVALBP20472 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PVALBP20472 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PVALBP20472 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PVALBP20472 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PVALBP20472 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PVALBP20472 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PVALBP20472 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms