Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGCP20142 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGCP20142 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGCP20142 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGCP20142 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGCP20142 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGCP20142 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGCP20142 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGCP20142 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PGCP20142 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGCP20142 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGCP20142 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGCP20142 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGCP20142 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PGCP20142 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGCP20142 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGCP20142 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGCP20142 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGCP20142 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGCP20142 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PGCP20142 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGCP20142 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PGCP20142 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PGCP20142 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PGCP20142 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PGCP20142 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PGCP20142 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGCP20142 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PGCP20142 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PGCP20142 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGCP20142 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PGCP20142 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGCP20142 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PGCP20142 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGCP20142 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PGCP20142 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PGCP20142 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGCP20142 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGCP20142 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGCP20142 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PGCP20142 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PGCP20142 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PGCP20142 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PGCP20142 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PGCP20142 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PGCP20142 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGCP20142 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGCP20142 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PGCP20142 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGCP20142 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGCP20142 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGCP20142 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PGCP20142 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PGCP20142 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGCP20142 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGCP20142 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGCP20142 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGCP20142 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PGCP20142 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PGCP20142 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGCP20142 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGCP20142 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGCP20142 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGCP20142 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PGCP20142 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms