Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ATP2B1P20020 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ATP2B1P20020 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP2B1P20020 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ATP2B1P20020 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATP2B1P20020 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATP2B1P20020 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms