Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFE3P19532 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TFE3P19532 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TFE3P19532 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TFE3P19532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TFE3P19532 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFE3P19532 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFE3P19532 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TFE3P19532 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFE3P19532 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFE3P19532 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TFE3P19532 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFE3P19532 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TFE3P19532 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFE3P19532 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFE3P19532 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TFE3P19532 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFE3P19532 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFE3P19532 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFE3P19532 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFE3P19532 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFE3P19532 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFE3P19532 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFE3P19532 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFE3P19532 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFE3P19532 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFE3P19532 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFE3P19532 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TFE3P19532 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFE3P19532 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFE3P19532 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TFE3P19532 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFE3P19532 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFE3P19532 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFE3P19532 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFE3P19532 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFE3P19532 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFE3P19532 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFE3P19532 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFE3P19532 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFE3P19532 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFE3P19532 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFE3P19532 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFE3P19532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TFE3P19532 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFE3P19532 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TFE3P19532 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TFE3P19532 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFE3P19532 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFE3P19532 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFE3P19532 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFE3P19532 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFE3P19532 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFE3P19532 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFE3P19532 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFE3P19532 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFE3P19532 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFE3P19532 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFE3P19532 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TFE3P19532 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TFE3P19532 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFE3P19532 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFE3P19532 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFE3P19532 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFE3P19532 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFE3P19532 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFE3P19532 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFE3P19532 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFE3P19532 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFE3P19532 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFE3P19532 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFE3P19532 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFE3P19532 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFE3P19532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFE3P19532 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFE3P19532 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFE3P19532 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TFE3P19532 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFE3P19532 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFE3P19532 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFE3P19532 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TFE3P19532 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TFE3P19532 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFE3P19532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms