Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TNNI3P19429 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TNNI3P19429 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNI3P19429 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI3P19429 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNNI3P19429 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNNI3P19429 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms