Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CTPS1P17812 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTPS1P17812 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTPS1P17812 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTPS1P17812 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTPS1P17812 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CTPS1P17812 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTPS1P17812 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms