Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDGFRAP16234 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDGFRAP16234 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDGFRAP16234 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFRAP16234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDGFRAP16234 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFRAP16234 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFRAP16234 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFRAP16234 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDGFRAP16234 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFRAP16234 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDGFRAP16234 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFRAP16234 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDGFRAP16234 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PDGFRAP16234 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PDGFRAP16234 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PDGFRAP16234 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFRAP16234 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.7 ms