Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NME1P15531 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NME1P15531 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NME1P15531 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NME1P15531 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NME1P15531 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NME1P15531 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME1P15531 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NME1P15531 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME1P15531 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME1P15531 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NME1P15531 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME1P15531 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NME1P15531 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NME1P15531 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME1P15531 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME1P15531 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NME1P15531 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME1P15531 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NME1P15531 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME1P15531 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NME1P15531 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NME1P15531 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME1P15531 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NME1P15531 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME1P15531 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NME1P15531 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME1P15531 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NME1P15531 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NME1P15531 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NME1P15531 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NME1P15531 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NME1P15531 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NME1P15531 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NME1P15531 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME1P15531 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME1P15531 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME1P15531 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME1P15531 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NME1P15531 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME1P15531 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NME1P15531 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME1P15531 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME1P15531 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME1P15531 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NME1P15531 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME1P15531 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME1P15531 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME1P15531 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NME1P15531 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NME1P15531 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME1P15531 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NME1P15531 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME1P15531 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME1P15531 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME1P15531 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME1P15531 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NME1P15531 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME1P15531 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME1P15531 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME1P15531 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME1P15531 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NME1P15531 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NME1P15531 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NME1P15531 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NME1P15531 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NME1P15531 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NME1P15531 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NME1P15531 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NME1P15531 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NME1P15531 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NME1P15531 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NME1P15531 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms