Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALAP11233 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALAP11233 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RALAP11233 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RALAP11233 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RALAP11233 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RALAP11233 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RALAP11233 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RALAP11233 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RALAP11233 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RALAP11233 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RALAP11233 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALAP11233 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALAP11233 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALAP11233 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RALAP11233 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALAP11233 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALAP11233 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RALAP11233 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RALAP11233 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RALAP11233 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RALAP11233 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALAP11233 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALAP11233 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALAP11233 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALAP11233 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RALAP11233 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RALAP11233 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RALAP11233 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RALAP11233 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RALAP11233 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RALAP11233 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RALAP11233 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RALAP11233 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RALAP11233 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RALAP11233 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALAP11233 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RALAP11233 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RALAP11233 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RALAP11233 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RALAP11233 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RALAP11233 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RALAP11233 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RALAP11233 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RALAP11233 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RALAP11233 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RALAP11233 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RALAP11233 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RALAP11233 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RALAP11233 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RALAP11233 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RALAP11233 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALAP11233 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALAP11233 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RALAP11233 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RALAP11233 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RALAP11233 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RALAP11233 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RALAP11233 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RALAP11233 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RALAP11233 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALAP11233 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RALAP11233 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RALAP11233 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RALAP11233 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RALAP11233 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RALAP11233 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RALAP11233 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RALAP11233 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RALAP11233 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RALAP11233 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RALAP11233 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RALAP11233 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALAP11233 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALAP11233 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALAP11233 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RALAP11233 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RALAP11233 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALAP11233 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RALAP11233 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RALAP11233 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RALAP11233 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RALAP11233 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms