Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UMPSP11172 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UMPSP11172 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UMPSP11172 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UMPSP11172 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UMPSP11172 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UMPSP11172 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UMPSP11172 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UMPSP11172 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UMPSP11172 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UMPSP11172 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UMPSP11172 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UMPSP11172 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UMPSP11172 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UMPSP11172 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UMPSP11172 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UMPSP11172 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UMPSP11172 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UMPSP11172 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UMPSP11172 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UMPSP11172 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
UMPSP11172 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UMPSP11172 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UMPSP11172 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UMPSP11172 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UMPSP11172 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UMPSP11172 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UMPSP11172 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UMPSP11172 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UMPSP11172 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UMPSP11172 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UMPSP11172 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UMPSP11172 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UMPSP11172 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UMPSP11172 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UMPSP11172 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UMPSP11172 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UMPSP11172 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UMPSP11172 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UMPSP11172 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UMPSP11172 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UMPSP11172 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UMPSP11172 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UMPSP11172 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UMPSP11172 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UMPSP11172 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UMPSP11172 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UMPSP11172 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UMPSP11172 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UMPSP11172 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UMPSP11172 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UMPSP11172 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UMPSP11172 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UMPSP11172 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UMPSP11172 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UMPSP11172 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UMPSP11172 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UMPSP11172 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UMPSP11172 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UMPSP11172 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UMPSP11172 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UMPSP11172 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UMPSP11172 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UMPSP11172 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UMPSP11172 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UMPSP11172 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UMPSP11172 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UMPSP11172 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UMPSP11172 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UMPSP11172 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UMPSP11172 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UMPSP11172 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UMPSP11172 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UMPSP11172 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UMPSP11172 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UMPSP11172 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UMPSP11172 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UMPSP11172 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UMPSP11172 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UMPSP11172 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UMPSP11172 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UMPSP11172 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UMPSP11172 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UMPSP11172 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms