Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
LAMC1P11047 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LAMC1P11047 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.75■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
LAMC1P11047 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
LAMC1P11047 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LAMC1P11047 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
LAMC1P11047 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
LAMC1P11047 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
LAMC1P11047 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms