Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRBP10828 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
THRBP10828 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRBP10828 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
THRBP10828 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRBP10828 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRBP10828 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THRBP10828 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRBP10828 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THRBP10828 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRBP10828 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRBP10828 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THRBP10828 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRBP10828 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THRBP10828 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRBP10828 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THRBP10828 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRBP10828 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRBP10828 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRBP10828 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRBP10828 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRBP10828 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRBP10828 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRBP10828 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRBP10828 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRBP10828 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRBP10828 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRBP10828 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRBP10828 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRBP10828 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRBP10828 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRBP10828 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRBP10828 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRBP10828 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THRBP10828 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THRBP10828 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRBP10828 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THRBP10828 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THRBP10828 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THRBP10828 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRBP10828 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THRBP10828 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THRBP10828 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRBP10828 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THRBP10828 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRBP10828 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRBP10828 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRBP10828 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRBP10828 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THRBP10828 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRBP10828 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRBP10828 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THRBP10828 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRBP10828 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
THRBP10828 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRBP10828 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
THRBP10828 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
THRBP10828 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
THRBP10828 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
THRBP10828 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRBP10828 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
THRBP10828 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRBP10828 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRBP10828 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRBP10828 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
THRBP10828 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRBP10828 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
THRBP10828 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRBP10828 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRBP10828 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRBP10828 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRBP10828 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
THRBP10828 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRBP10828 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRBP10828 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
THRBP10828 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
THRBP10828 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRBP10828 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRBP10828 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRBP10828 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THRBP10828 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRBP10828 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRBP10828 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRBP10828 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THRBP10828 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THRBP10828 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRBP10828 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THRBP10828 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRBP10828 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRBP10828 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms