Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD63P08962 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD63P08962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD63P08962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD63P08962 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD63P08962 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD63P08962 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD63P08962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD63P08962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD63P08962 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD63P08962 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD63P08962 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD63P08962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD63P08962 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD63P08962 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD63P08962 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD63P08962 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CD63P08962 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD63P08962 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD63P08962 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD63P08962 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD63P08962 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD63P08962 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD63P08962 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD63P08962 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD63P08962 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD63P08962 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD63P08962 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD63P08962 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD63P08962 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD63P08962 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD63P08962 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD63P08962 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD63P08962 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD63P08962 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD63P08962 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD63P08962 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD63P08962 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CD63P08962 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CD63P08962 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD63P08962 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD63P08962 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD63P08962 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CD63P08962 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD63P08962 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CD63P08962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD63P08962 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD63P08962 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD63P08962 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD63P08962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD63P08962 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD63P08962 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD63P08962 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CD63P08962 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD63P08962 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD63P08962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD63P08962 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD63P08962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD63P08962 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD63P08962 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD63P08962 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD63P08962 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD63P08962 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD63P08962 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD63P08962 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD63P08962 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD63P08962 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD63P08962 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD63P08962 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD63P08962 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD63P08962 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD63P08962 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD63P08962 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD63P08962 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD63P08962 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD63P08962 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD63P08962 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD63P08962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD63P08962 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD63P08962 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD63P08962 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms