Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA5P08648 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ITGA5P08648 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ITGA5P08648 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITGA5P08648 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGA5P08648 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGA5P08648 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms