Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ERCC1P07992 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC1P07992 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC1P07992 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC1P07992 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC1P07992 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms