Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APODP05090 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
APODP05090 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APODP05090 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APODP05090 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
APODP05090 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APODP05090 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
APODP05090 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
APODP05090 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APODP05090 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APODP05090 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
APODP05090 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
APODP05090 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
APODP05090 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APODP05090 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
APODP05090 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APODP05090 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
APODP05090 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
APODP05090 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APODP05090 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
APODP05090 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APODP05090 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APODP05090 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
APODP05090 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
APODP05090 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
APODP05090 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APODP05090 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APODP05090 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APODP05090 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APODP05090 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
APODP05090 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APODP05090 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
APODP05090 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
APODP05090 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APODP05090 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APODP05090 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
APODP05090 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
APODP05090 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
APODP05090 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
APODP05090 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APODP05090 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
APODP05090 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
APODP05090 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
APODP05090 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APODP05090 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APODP05090 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
APODP05090 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
APODP05090 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
APODP05090 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
APODP05090 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APODP05090 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
APODP05090 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
APODP05090 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
APODP05090 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APODP05090 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
APODP05090 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
APODP05090 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
APODP05090 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
APODP05090 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APODP05090 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APODP05090 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
APODP05090 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
APODP05090 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
APODP05090 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APODP05090 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
APODP05090 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
APODP05090 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
APODP05090 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
APODP05090 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APODP05090 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
APODP05090 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
APODP05090 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APODP05090 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APODP05090 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
APODP05090 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
APODP05090 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
APODP05090 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
APODP05090 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APODP05090 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APODP05090 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
APODP05090 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
APODP05090 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APODP05090 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
APODP05090 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APODP05090 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APODP05090 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APODP05090 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
APODP05090 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APODP05090 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
APODP05090 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
APODP05090 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms