Protein–RNA interactions for Protein: P05000

IFNW1, Interferon omega-1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNW1P05000 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNW1P05000 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IFNW1P05000 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IFNW1P05000 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IFNW1P05000 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IFNW1P05000 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNW1P05000 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.9 ms