Protein–RNA interactions for Protein: P04746

AMY2A, Pancreatic alpha-amylase, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2AP04746 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AMY2AP04746 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AMY2AP04746 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AMY2AP04746 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AMY2AP04746 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AMY2AP04746 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AMY2AP04746 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMY2AP04746 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMY2AP04746 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms