Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VTNP04004 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VTNP04004 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VTNP04004 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VTNP04004 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VTNP04004 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VTNP04004 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VTNP04004 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VTNP04004 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VTNP04004 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTNP04004 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTNP04004 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTNP04004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTNP04004 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTNP04004 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTNP04004 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTNP04004 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VTNP04004 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTNP04004 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTNP04004 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTNP04004 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTNP04004 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VTNP04004 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VTNP04004 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VTNP04004 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VTNP04004 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VTNP04004 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VTNP04004 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VTNP04004 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VTNP04004 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VTNP04004 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VTNP04004 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VTNP04004 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VTNP04004 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTNP04004 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTNP04004 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTNP04004 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTNP04004 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VTNP04004 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VTNP04004 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VTNP04004 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VTNP04004 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VTNP04004 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VTNP04004 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTNP04004 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VTNP04004 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTNP04004 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTNP04004 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTNP04004 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VTNP04004 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VTNP04004 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VTNP04004 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VTNP04004 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VTNP04004 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VTNP04004 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VTNP04004 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
VTNP04004 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTNP04004 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTNP04004 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTNP04004 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTNP04004 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VTNP04004 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VTNP04004 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VTNP04004 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTNP04004 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTNP04004 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTNP04004 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTNP04004 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTNP04004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VTNP04004 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VTNP04004 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTNP04004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
VTNP04004 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTNP04004 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTNP04004 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTNP04004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTNP04004 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTNP04004 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTNP04004 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
VTNP04004 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTNP04004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTNP04004 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VTNP04004 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTNP04004 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTNP04004 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTNP04004 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
VTNP04004 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms