Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFPP02771 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFPP02771 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AFPP02771 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AFPP02771 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AFPP02771 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFPP02771 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AFPP02771 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFPP02771 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFPP02771 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AFPP02771 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AFPP02771 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFPP02771 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AFPP02771 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AFPP02771 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFPP02771 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFPP02771 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFPP02771 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AFPP02771 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFPP02771 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFPP02771 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AFPP02771 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFPP02771 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFPP02771 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AFPP02771 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AFPP02771 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
AFPP02771 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFPP02771 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFPP02771 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AFPP02771 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AFPP02771 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AFPP02771 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
AFPP02771 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFPP02771 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFPP02771 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
AFPP02771 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFPP02771 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
AFPP02771 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
AFPP02771 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
AFPP02771 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
AFPP02771 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
AFPP02771 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
AFPP02771 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AFPP02771 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFPP02771 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFPP02771 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AFPP02771 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFPP02771 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFPP02771 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFPP02771 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
AFPP02771 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFPP02771 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AFPP02771 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFPP02771 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFPP02771 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
AFPP02771 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFPP02771 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AFPP02771 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
AFPP02771 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AFPP02771 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AFPP02771 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AFPP02771 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFPP02771 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFPP02771 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFPP02771 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AFPP02771 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFPP02771 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AFPP02771 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFPP02771 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AFPP02771 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFPP02771 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFPP02771 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFPP02771 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFPP02771 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AFPP02771 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AFPP02771 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
AFPP02771 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFPP02771 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
AFPP02771 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFPP02771 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFPP02771 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
AFPP02771 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AFPP02771 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AFPP02771 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AFPP02771 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFPP02771 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFPP02771 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AFPP02771 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
AFPP02771 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFPP02771 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AFPP02771 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFPP02771 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AFPP02771 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFPP02771 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AFPP02771 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 446.4 ms