Protein–RNA interactions for Protein: P01703

IGLV1-40, Immunoglobulin lambda variable 1-40, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV1-40P01703 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IGLV1-40P01703 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGLV1-40P01703 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
IGLV1-40P01703 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IGLV1-40P01703 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IGLV1-40P01703 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms