Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSTAP01040 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTAP01040 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSTAP01040 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTAP01040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSTAP01040 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTAP01040 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTAP01040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTAP01040 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSTAP01040 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSTAP01040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSTAP01040 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTAP01040 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSTAP01040 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTAP01040 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTAP01040 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSTAP01040 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTAP01040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTAP01040 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTAP01040 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTAP01040 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSTAP01040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTAP01040 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTAP01040 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTAP01040 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTAP01040 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSTAP01040 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTAP01040 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTAP01040 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTAP01040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTAP01040 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSTAP01040 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTAP01040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTAP01040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSTAP01040 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTAP01040 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTAP01040 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CSTAP01040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CSTAP01040 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTAP01040 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTAP01040 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CSTAP01040 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CSTAP01040 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSTAP01040 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSTAP01040 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTAP01040 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTAP01040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTAP01040 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSTAP01040 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTAP01040 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTAP01040 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTAP01040 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTAP01040 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTAP01040 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTAP01040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTAP01040 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTAP01040 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTAP01040 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTAP01040 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTAP01040 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTAP01040 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTAP01040 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTAP01040 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTAP01040 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTAP01040 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTAP01040 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTAP01040 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTAP01040 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTAP01040 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTAP01040 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTAP01040 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTAP01040 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTAP01040 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms