Protein–RNA interactions for Protein: P00739

HPR, Haptoglobin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPRP00739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPRP00739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPRP00739 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HPRP00739 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HPRP00739 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPRP00739 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPRP00739 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPRP00739 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPRP00739 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HPRP00739 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HPRP00739 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPRP00739 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HPRP00739 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HPRP00739 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPRP00739 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HPRP00739 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HPRP00739 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HPRP00739 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPRP00739 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPRP00739 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HPRP00739 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPRP00739 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPRP00739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPRP00739 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HPRP00739 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HPRP00739 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPRP00739 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HPRP00739 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPRP00739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPRP00739 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPRP00739 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HPRP00739 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HPRP00739 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPRP00739 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPRP00739 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HPRP00739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HPRP00739 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPRP00739 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPRP00739 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPRP00739 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPRP00739 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HPRP00739 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPRP00739 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPRP00739 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPRP00739 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HPRP00739 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPRP00739 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPRP00739 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HPRP00739 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPRP00739 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPRP00739 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPRP00739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPRP00739 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPRP00739 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPRP00739 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPRP00739 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPRP00739 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPRP00739 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPRP00739 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPRP00739 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPRP00739 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPRP00739 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPRP00739 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPRP00739 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPRP00739 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPRP00739 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPRP00739 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPRP00739 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPRP00739 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPRP00739 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPRP00739 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPRP00739 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPRP00739 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPRP00739 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPRP00739 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPRP00739 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPRP00739 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPRP00739 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPRP00739 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPRP00739 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPRP00739 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPRP00739 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPRP00739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HPRP00739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HPRP00739 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPRP00739 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HPRP00739 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HPRP00739 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPRP00739 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPRP00739 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPRP00739 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HPRP00739 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPRP00739 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPRP00739 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HPRP00739 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms