Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SEMA4FO95754 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SEMA4FO95754 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SEMA4FO95754 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEMA4FO95754 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEMA4FO95754 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4FO95754 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms