Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CBX6O95503 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX6O95503 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CBX6O95503 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX6O95503 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX6O95503 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CBX6O95503 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX6O95503 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX6O95503 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX6O95503 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CBX6O95503 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX6O95503 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX6O95503 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CBX6O95503 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX6O95503 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX6O95503 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CBX6O95503 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CBX6O95503 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX6O95503 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX6O95503 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CBX6O95503 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CBX6O95503 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CBX6O95503 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBX6O95503 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CBX6O95503 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CBX6O95503 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX6O95503 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX6O95503 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX6O95503 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX6O95503 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CBX6O95503 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX6O95503 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX6O95503 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX6O95503 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX6O95503 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CBX6O95503 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX6O95503 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX6O95503 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX6O95503 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CBX6O95503 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CBX6O95503 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX6O95503 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CBX6O95503 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CBX6O95503 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX6O95503 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX6O95503 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CBX6O95503 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CBX6O95503 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX6O95503 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CBX6O95503 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CBX6O95503 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CBX6O95503 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CBX6O95503 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX6O95503 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX6O95503 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CBX6O95503 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CBX6O95503 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CBX6O95503 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX6O95503 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX6O95503 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CBX6O95503 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CBX6O95503 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX6O95503 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CBX6O95503 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CBX6O95503 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX6O95503 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CBX6O95503 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX6O95503 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX6O95503 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX6O95503 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CBX6O95503 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX6O95503 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX6O95503 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX6O95503 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX6O95503 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CBX6O95503 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX6O95503 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX6O95503 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX6O95503 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CBX6O95503 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms