Protein–RNA interactions for Protein: O95460

MATN4, Matrilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN4O95460 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MATN4O95460 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MATN4O95460 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MATN4O95460 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MATN4O95460 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MATN4O95460 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MATN4O95460 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MATN4O95460 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MATN4O95460 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MATN4O95460 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MATN4O95460 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MATN4O95460 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MATN4O95460 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MATN4O95460 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MATN4O95460 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MATN4O95460 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MATN4O95460 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MATN4O95460 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MATN4O95460 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MATN4O95460 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MATN4O95460 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MATN4O95460 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MATN4O95460 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MATN4O95460 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MATN4O95460 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MATN4O95460 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MATN4O95460 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MATN4O95460 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MATN4O95460 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MATN4O95460 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MATN4O95460 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MATN4O95460 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MATN4O95460 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MATN4O95460 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MATN4O95460 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MATN4O95460 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN4O95460 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN4O95460 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN4O95460 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN4O95460 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MATN4O95460 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN4O95460 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MATN4O95460 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MATN4O95460 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MATN4O95460 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MATN4O95460 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MATN4O95460 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MATN4O95460 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MATN4O95460 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MATN4O95460 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN4O95460 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN4O95460 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN4O95460 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MATN4O95460 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN4O95460 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MATN4O95460 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN4O95460 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN4O95460 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN4O95460 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN4O95460 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MATN4O95460 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MATN4O95460 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MATN4O95460 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN4O95460 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MATN4O95460 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MATN4O95460 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MATN4O95460 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MATN4O95460 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MATN4O95460 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MATN4O95460 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MATN4O95460 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MATN4O95460 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN4O95460 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN4O95460 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MATN4O95460 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN4O95460 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN4O95460 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN4O95460 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN4O95460 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MATN4O95460 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN4O95460 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN4O95460 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN4O95460 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN4O95460 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MATN4O95460 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN4O95460 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN4O95460 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MATN4O95460 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms