Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATE1O95260 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATE1O95260 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATE1O95260 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATE1O95260 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATE1O95260 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATE1O95260 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATE1O95260 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATE1O95260 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATE1O95260 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATE1O95260 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATE1O95260 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATE1O95260 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATE1O95260 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATE1O95260 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATE1O95260 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATE1O95260 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATE1O95260 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATE1O95260 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATE1O95260 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATE1O95260 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATE1O95260 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATE1O95260 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATE1O95260 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATE1O95260 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATE1O95260 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATE1O95260 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATE1O95260 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATE1O95260 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATE1O95260 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATE1O95260 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATE1O95260 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATE1O95260 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATE1O95260 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATE1O95260 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATE1O95260 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATE1O95260 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATE1O95260 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATE1O95260 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATE1O95260 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATE1O95260 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATE1O95260 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATE1O95260 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATE1O95260 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATE1O95260 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATE1O95260 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATE1O95260 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATE1O95260 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATE1O95260 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATE1O95260 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATE1O95260 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATE1O95260 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATE1O95260 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATE1O95260 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATE1O95260 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATE1O95260 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATE1O95260 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATE1O95260 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATE1O95260 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATE1O95260 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATE1O95260 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATE1O95260 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATE1O95260 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATE1O95260 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATE1O95260 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATE1O95260 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATE1O95260 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATE1O95260 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATE1O95260 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATE1O95260 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATE1O95260 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATE1O95260 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATE1O95260 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATE1O95260 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATE1O95260 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATE1O95260 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATE1O95260 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATE1O95260 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATE1O95260 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms