Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX4O95219 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX4O95219 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX4O95219 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX4O95219 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX4O95219 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX4O95219 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX4O95219 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX4O95219 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX4O95219 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX4O95219 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX4O95219 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX4O95219 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX4O95219 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX4O95219 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX4O95219 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX4O95219 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX4O95219 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX4O95219 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX4O95219 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX4O95219 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX4O95219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX4O95219 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX4O95219 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX4O95219 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX4O95219 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX4O95219 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX4O95219 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX4O95219 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX4O95219 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX4O95219 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX4O95219 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX4O95219 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX4O95219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX4O95219 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX4O95219 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX4O95219 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX4O95219 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX4O95219 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX4O95219 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX4O95219 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX4O95219 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX4O95219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX4O95219 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX4O95219 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX4O95219 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX4O95219 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX4O95219 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX4O95219 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX4O95219 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX4O95219 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX4O95219 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX4O95219 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX4O95219 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX4O95219 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX4O95219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX4O95219 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX4O95219 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX4O95219 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX4O95219 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX4O95219 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX4O95219 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX4O95219 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX4O95219 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX4O95219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX4O95219 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX4O95219 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX4O95219 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX4O95219 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX4O95219 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX4O95219 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms