Protein–RNA interactions for Protein: O75923

DYSF, Dysferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,080 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSFO75923 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYSFO75923 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYSFO75923 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYSFO75923 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYSFO75923 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYSFO75923 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYSFO75923 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYSFO75923 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DYSFO75923 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYSFO75923 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYSFO75923 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DYSFO75923 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYSFO75923 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYSFO75923 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYSFO75923 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYSFO75923 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYSFO75923 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYSFO75923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYSFO75923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYSFO75923 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYSFO75923 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYSFO75923 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYSFO75923 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYSFO75923 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYSFO75923 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYSFO75923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYSFO75923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DYSFO75923 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYSFO75923 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DYSFO75923 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DYSFO75923 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DYSFO75923 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYSFO75923 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DYSFO75923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYSFO75923 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DYSFO75923 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYSFO75923 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DYSFO75923 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYSFO75923 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DYSFO75923 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DYSFO75923 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DYSFO75923 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYSFO75923 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYSFO75923 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DYSFO75923 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DYSFO75923 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DYSFO75923 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DYSFO75923 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYSFO75923 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DYSFO75923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYSFO75923 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DYSFO75923 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DYSFO75923 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYSFO75923 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYSFO75923 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYSFO75923 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYSFO75923 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DYSFO75923 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYSFO75923 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYSFO75923 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYSFO75923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DYSFO75923 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYSFO75923 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYSFO75923 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DYSFO75923 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DYSFO75923 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DYSFO75923 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DYSFO75923 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DYSFO75923 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYSFO75923 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DYSFO75923 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DYSFO75923 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYSFO75923 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYSFO75923 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DYSFO75923 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYSFO75923 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYSFO75923 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYSFO75923 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DYSFO75923 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DYSFO75923 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYSFO75923 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DYSFO75923 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DYSFO75923 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DYSFO75923 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms