Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GCATO75600 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCATO75600 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GCATO75600 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCATO75600 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCATO75600 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCATO75600 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
GCATO75600 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GCATO75600 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GCATO75600 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GCATO75600 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GCATO75600 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCATO75600 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GCATO75600 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCATO75600 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GCATO75600 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCATO75600 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCATO75600 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCATO75600 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GCATO75600 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCATO75600 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GCATO75600 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCATO75600 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GCATO75600 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCATO75600 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GCATO75600 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCATO75600 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCATO75600 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GCATO75600 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCATO75600 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCATO75600 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GCATO75600 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCATO75600 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCATO75600 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCATO75600 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCATO75600 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GCATO75600 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GCATO75600 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GCATO75600 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCATO75600 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GCATO75600 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GCATO75600 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCATO75600 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCATO75600 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GCATO75600 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GCATO75600 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCATO75600 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GCATO75600 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GCATO75600 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GCATO75600 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCATO75600 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCATO75600 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCATO75600 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GCATO75600 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCATO75600 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GCATO75600 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCATO75600 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GCATO75600 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCATO75600 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GCATO75600 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCATO75600 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCATO75600 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCATO75600 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCATO75600 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GCATO75600 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCATO75600 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GCATO75600 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCATO75600 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GCATO75600 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GCATO75600 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCATO75600 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GCATO75600 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCATO75600 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GCATO75600 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GCATO75600 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCATO75600 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCATO75600 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GCATO75600 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCATO75600 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCATO75600 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCATO75600 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCATO75600 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCATO75600 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCATO75600 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCATO75600 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCATO75600 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCATO75600 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCATO75600 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCATO75600 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCATO75600 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCATO75600 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCATO75600 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCATO75600 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms