Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLEC3AO75596 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLEC3AO75596 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLEC3AO75596 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLEC3AO75596 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLEC3AO75596 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLEC3AO75596 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLEC3AO75596 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms