Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA10O75578 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA10O75578 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA10O75578 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ITGA10O75578 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ITGA10O75578 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms