Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTRF1O75570 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTRF1O75570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTRF1O75570 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTRF1O75570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MTRF1O75570 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MTRF1O75570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms