Protein–RNA interactions for Protein: O75509

TNFRSF21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF21O75509 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNFRSF21O75509 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF21O75509 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNFRSF21O75509 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNFRSF21O75509 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNFRSF21O75509 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms